"Trzeci oficer", podobnie jak wcześniej "Oficerowie", nie stanowi bezpośredniej kontynuacji historii opowiedzianej w poprzedniej serii, chociaż w poszczególnych odcinkach pojawiają się nawiązania do wydarzeń, które rozegrały się bądź to w "Oficerze" bądź właśnie w "Oficerach". Na ekranie występują też osoby dobrze już znane z wcześniejszych odcinków: komisarz Tomasz Kruszyński "Kruszon", nadkomisarz Aldona Ginko - Ryś, która z pracy w policji przeszła do prokuratury, podinspektor Marek Sznajder, dowódca Specjalnej Grupy Pościgowej CBŚ, podkomisarz Alicja Szymczyszyn, Damian Ryś, Jacek Wielgosz ps. "Grand" i jego piękna żona Rita czy też szef wywiadu, gen. Michał Matejewski. Twórcom filmu udało się zachować klimat obu poprzednich serii: atmosferę tajemnicy, niedopowiedzenia, napięcia, oczekiwania. Obserwujemy kulisy międzynarodowych machinacji przestępczych, a jednocześnie żmudną, choć zarazem pasjonującą pracę grup specjalnych policji usiłujących rozwiązać skomplikowane zagadki kryminalne. Zaglądamy również za kulisy działań wywiadu, gdzie zasada: "cel uświęca środki" staje się często zasadą naczelną.