Po szokujących wydarzeniach finałowego odcinka poprzedniego sezonu, Dexter wciąż czuje się odpowiedzialny za śmierć Rity, a może nawet nieco winny... Dexter nie mogąc poradzić sobie z traumą po śmierci Rity, podejmuje drastyczną decyzję, która wpływa na wszystkich dookoła. Quinn jest zaniepokojony, ponieważ dostrzega iż, morderstwo Rity - przypisywane Trinity nie pasuje do jego profilu mordercy. Sprawa nabiera tempa gdy Quinn sugeruje LaGuercie przesłuchanie męża Rity - Dextera. W międzyczasie, Quinn proponuje Debrze wsparcie. Od tego momentu Debra patrzy na Quinna nieco łaskawiej.

Dexter próbuje odnaleźć się w nowej roli - jako samotny ojciec oraz stara się przywrócić rodzinie równowagę po śmierci Rity. Dexter skupia swoją uwagę na dzieciach, tłumiąc jednocześnie swoje mroczne pragnienia. Dexter natrafia na pewne ślady i dokonuje makabrycznego odkrycia. To odkyrcie sugeruje mu, kto powinien być jego kolejną ofiarą. Debra stara się pomóc bratu i dzieli z nim i dziećmi mieszkanie. Wkrótce okaże się jednak, że nie ma tam dla niej miejsca. Nieszczęśliwa, pojawia się przed drzwiami mieszkania Quinna.

Dexter szuka niani dla Harrisona, by sam mógł śledzić i zabić swoją kolejną ofiarę. W międzyczasie Debra prowadzi śledztwo w sprawie dziwnego, podwójnego zabójstwa. Jest niezadowolona, ponieważ Batista chce zaangażować w sprawę młodego, zadzierającego nosa oficera. Sprawa Dextera nabiera tempa gdy Quinn zauważa podobieństwo między Dexterem i Kyle Butler.

Dexter znalazł się w dziwnej sytuacji - zamiast odebrać komuś życie, będzie musiał jedno ocalić. Deb czeka konfrontacja z głównym podejrzanym w sprawie morderstw w Santa Muerte. Quinn kontynuuje analizowanie podejrzanych podobieństw między Dexterem i Kyle Butler.

Dexter zastanawia się czy śmierć Rity nie rozbudzi zła tkwiącego w Harrisonie. Ponieważ Quinn został ostatnio zawieszony, Debra pracuje sama nad sprawą Santa Muerte. Quinn ma czas by, zaangażować przyjaciela, który przyjrzy się sprawie Dextera i śmierci Rity.

Dexter stara się przywrócić swojemu życiu równowagę. Śledzi swój nowy cel. Jest jednak rozkojarzony. Pomagając swojej nowej znajomej, wpada w kłopoty. Batista odkrywa nowy ślad w sprawie Santa Muerte. Quinn otrzymuje nowe, niepewne informacje o Dexterze.

Dexter (Michael C. Hall) wchodzi w drogę Debrze (Jennifer Carpenter), kiedy zostaje wezwany na miejsce okrutnej zbrodni. Między Debrą i zabójcami Santa Muerte dochodzi do ostrej konfrontacji.

Dexter i Lumen śledzą brutalnego mordercę, uczęszczając na kurs samorozwoju. Tymczasem skutki sprawy Santa Muerte wpędzają Debrę w kłopoty.

Kiedy Dexter i Lumen tropią swoją kolejną ofiarę, zostają zaskoczeni powrotem niezapowiedzianego gościa. Debra zostaje przydzielona do pracy biurowej, jednak wciąż odkrywa nowe ślady w sprawie Barrel Girl.

Dexter znajduje potencjalnego sprzymierzeńca, który mógłby pomóc mu odnaleźć oprawców Lumen. On i Lumen rezygnują z dalszego tropienia mordercy, gdy odkrywa on dowody łączące Dextera i Lumen z jedną z ich poprzednich ofiar. Debra została przydzielona do sprawy Barrel Girls. Udaje jej się zidentyfikować kolejnych dwóch podejrzanych.

Dextera I Lumen zostają pokrzyżowane, gdy Dexter dowiaduje się, że ktoś spoza Miami Metro zaczął się nimi interesować. Podejrzenia Debry w sprawie Barrel Girl stają się coraz bardziej realne. Quinn angażuje się w sprawę morderstwa bardziej niż by tego chciał.

W finałowym odcinku Dextera, sytuacja robi się coraz bardziej dramatyczna gdy Lumen zostaje złapana. Pomimo tego, że Dexter wie, że ktoś chce go zwabić, mimo to ryzykuje wszystko by nie popełnić takich samych błędów jak kiedyś. Uczucia zaczynają rządzić Debrą w sprawie Barrel Girl. Quinn wpada w tarapaty, z których może go wyciągnąć tylko Dexter.