W początkach czasu, na cudownej wyspie-mieście Metru Nui, wszyscy wierzyli, że już nie narodzi się żadna nowa legenda. Byli w błędzie... Nowy, pełnometrażowy film Bionicle 2: Legendy Metru Nui zrealizowany przy wykorzystaniu animacji CGI, zabiera widza wstecz, by odkryli pochodzenie świata Bionicle. Akcja rozgrywa się na wyspie Metru Nui, gdzie żyje tysiące Matoran. Ich spokój zostaje jednak zmącony przez nadciągającą ciemność. Toa Lihkan - protektor Metru Nui zostaje porwany przez tajemniczych Mrocznych Myśliwych. W ostatniej chwili udaje mu się przekazać kamienie Toa sześciu zaufanym Matoranom - po jednym z każdej części miasta - by zanieśli je do Wielkiej Świątyni. Tam odkrywają prawdziwy dar Lhikana - dzięki potędze kamieni, Matoranie przeobrażają się w sześciu nowych Toa Metru! Vakama, Nokama, Onewa, Nuju, Whenua i Matau muszą teraz wyzwolić wyspę i jej mieszkańców spod zgubnego wpływu cienia... czy jednak mają wystarczającą moc? Chcąc stać się prawdziwymi Toa, ruszają w podróż, podczas której stawiają czoła nowym wrogom, znajdują dziwnych sojuszników i przekonują się, że nic na Metru Nui nie jest tym, czym wydaje się być. Odkrywają także prawdziwe oblicze zła, które zagraża ich miastu.