Prof. Waldo Cunningham wyznacza ultimatum prezydentowi USA, żądając miliarda w złocie, w zamian za ocalenie Waszyngtonu. W tym samym czasie, dwóch wojskowych nurków odnajduje ukrytego na dnie oceanu Nautilusa i zahibernowanego kapitana Nemo. Wróciwszy do życia, kapitan zgadza się, by amerykańska marynarka naprawiła jego statek, aby z nową załogą mógł wyruszyć na poszukiwanie Atlantydy. Zanim jednak do tego dojdzie, przyjdzie mu się zmierzyć z Cunninghamem, ukrywającym się gdzieś w oceanie, w swojej eksperymentalnej łodzi podwodnej.