Serial opowiada o grupie badawczej, która w poszukiwaniu technologii pradawnych przybyła do innej galaktyki i "osiedliła" się w opuszczonej przez nich bazie "Atlantis". Napotykają jednak groźnego przeciwnika - rasę obcych (Wraith), którzy żywią się ludźmi, wysysając z nich "lata życia".