By poprawić wyniki japońskiej reprezentacji piłki nożnej, stworzony zostaje programu o nazwie „Blue Lock”. Jego dyrektor Ego Jinpachi zamyka trzystu młodych napastników w specjalnym ośrodku, gdzie zostają poddani rygorystycznemu treningowi, mającemu na celu stworzenie idealnego napastnika. Wśród wybrańców znajduje się również niczym nie wyróżniający się Isagi Yoichi.
Przybity Yoichi Isagi, którego szkolna drużyna piłkarska nie zakwalifikowała się do rozgrywek krajowych, przyjeżdża do domu, gdzie czeka na niego zaskakujące zaproszenie.
W pierwszym meczu selekcyjnym Drużyna Z gra z Drużyną X, ale pewna zasada sprawia, że zawodnicy walczą zarówno z przeciwnikami, jak i z kolegami z własnej drużyny.
Przed kolejnym meczem zawodnicy Drużyny Z dyskutują o swoich mocnych stronach, ale Isagi nie wie, na czym one polegają, dopóki nie usiądzie do stołu z Kunigamim.
Zbliża się kolejny mecz. Drużyna Z układa strategię na mecz z Drużyną W, w której grają groźni bracia Wanimowie. Dzięki Kuonowi jego drużyna szybko obejmuje prowadzenie.
Zmniejszona do 10 osób Drużyna Z gryzie trawę, żeby zostać w grze. Zainspirowany uporem i determinacją swojego zespołu Chigiri wreszcie uwalnia swój potencjał.
Zawodnicy Drużyny V wywierają presję na Isagiego i pozostałych, ale kiedy wydaje się, że nie ma już nadziei, Bachira wyprowadza atak, który dodaje wigoru jego kolegom.
Gdy Drużyna Z doprowadza do remisu, Nagi z Drużyny V przejmuje inicjatywę i pokazuje, do czego jest zdolny. Isagi rozpaczliwie szuka sposobu, żeby strzelić gola.
Na pierwszym etapie drugiej selekcji Isagi musi strzelić w ciągu 90 minut 100 goli stojącej w bramce sztucznej inteligencji. Potem tworzy zespół z Nagim i Bachirą.
Wiedząc, że następny mecz może być ich ostatnim, Isagi i Nagi zastanawiają się, komu powinni rzucić wyzwanie i jak najlepiej wykorzystać swoje indywidualne mocne strony.
Isagi musi znaleźć sposób, żeby pokonać swoje ograniczenia w meczu „dwóch na dwóch”. Obserwacja ruchów zdesperowanego Naruhayi na boisku nasuwa mu pewien pomysł.
Chigiri, Kunigami i Reo harmonijnie ze sobą współpracują, co daje im przewagę nad Isagim i jego kolegami, którzy mają problemy z nadawaniem na tych samych falach.
Isagi musi znaleźć sposób, żeby minąć Rina i doprowadzić do remisu. Wyprowadza przemyślany atak. Bachira rozpaczliwie walczy o uznanie Isagiego i Rina.
Po strzeleniu zwycięskiego gola wygrywający zespół wybiera piątego zawodnika. Ego mówi, że trzecia selekcja odbędzie się na obozie z udziałem zawodników światowej klasy.
Zespół Rina szybko zdobywa prowadzenie w meczu ze znakomitymi atakującymi z różnych krajów, ale zaraz potem zostaje zmiażdżony ich niesamowitymi umiejętnościami.
Przed arcyważnym meczem Ego wybiera sześciu najlepszych graczy, którzy mają stanowić trzon zespołu Blue Lock. O resztę miejsc w składzie trzeba będzie zawalczyć.
Isagi wraz z Rinem i Shidou próbują wybić się w drużynie A, ale Karasu, zawodnik z drużyny B, wciąż ich pokonuje za pomocą różnych trików i niezwykłego sprytu.
Przetasowana drużyna A gra z drużyną C z Yukimiyą i Nagim w składzie. Yukimiya popisuje się dryblingiem i zbliża się do bramki, żeby spróbować strzelić gola.