Gibbsa i jego zespół dotyka tragedia, bowiem ginie bliska im wszystkim osoba. Gdy śledztwo nad śmiercią członka NCIS nabiera tempa, Gibbs odkrywa, że wszystko jest powiązane z jego akcjami, które przeprowadzał kilka lat temu. Wkrótce w całych strukturach agencji zostają dokonane poważne zmiany personalne.
Dyrektorka NCIS Jenny Sheppard jedzie na pogrzeb zmarłego agenta. Podróżujący z nią Ziva i Tony nie odstępują jej na krok, jednak Jenny daje im wolne. Niebawem dołącza do niej stary znajomy Mike Franks, który ma jej pomóc.