U progu nowego tysiąclecia, w Jerozolimie - mieście na styku trzech religii - na tyłach małego sklepiku, archeolog (Olivia Williams) odnajduje tajemniczy grób. Odkryte szczątki noszą ślady zadania śmierci poprzez ukrzyżowanie. Odnaleziona przy nich moneta pochodzi z czasów Poncjusza Piłata. Czyj to grób? Odpowiedź na to pytanie może mieć daleko idące konsekwencje. Może wpłynąć na przekonania i wiarę setek milionów ludzi. Watykan reaguje natychmiast. Do Jerozolimy wysyła księdza Matta Gutierreza (Antonio Banderas) celem wyjaśnienia sprawy. Sytuacja jest bardzo trudna i wymaga niestandardowych działań. Wokół narasta konflikt polityczny i religijny...