U.S.S. Enterprise znowu dumnie wzbija się w przestrzeń w nowoczesnej, reżyserskiej wersji filmu Star Trek. Kiedy nieznana, obca siła niszczy kilka kligońskich statków, James T. Kirk powraca na kapitański mostek. Załoga mobilizuje siły, aby powstrzymać niszczycielskie zapędy obcego intruza nieubłaganie zmierzającego w stronę Ziemi.