Ekscentryczny profesor Daniel Pierce zostaje zatrudniony przez swoją byłą studentkę, a obecnie agentkę FBI Kate Moretti, do pomocy w śledztwie w sprawie śmierci farmaceuty. Schizofreniczne halucynacje Daniela, mogą utrudniać mu udział w dochodzeniu.

Moretti zwraca się do Pierce'a o pomoc w rozwiązaniu zagadkowego morderstwa, w które uwikłany jest mężczyzna podejrzany o zabicie narzeczonej. Sprawa przybiera niespodziewany obrót, kiedy okazuje się, że cierpi on na schorzenie, które uniemożliwia rozpoznawanie twarzy. Tymczasem uwagę Moretti przyciąga nowy przystojny profesor (w roli gościnnie Jamie Bamber).

Pierce i Moretti muszą szybko znaleźć jakieś wskazówki, kiedy seryjny zabójca z roku 1986 zaczyna ponownie zabijać. Oddychają z ulgą, gdy dowiadują się, że jedna z ofiar przeżyła (w tej roli Sheryl Lee). Ojciec Moretti, jeden ze śledczych podczas pierwszej sprawy, oferuje córce pomoc. W roli matki ocalałej ofiary występuje Pamela Reed, a Armin Shimerman gra psychologa ofiary.

Pierce stara się odszyfrować zakodowaną wiadomość pozostawioną w gazecie przez kogoś, kto może być powiązany z morderstwem. Nie ma na to zbyt wiele czasu, a życie kolejnej ofiary może być w niebezpieczeństwie. Gościnnie występują Neal McDonough i Cary Elwes.

Kiedy młody mężczyzna należący do sekty twierdzi, że słyszy głos Boga, Pierce musi ustalić, czy rzeczywiście jest to słowo boże, czy zagrażająca życiu choroba o podłożu neurologicznym. Pierce i Moretti muszą również dowiedzieć się, czy jego zamordowanie wiąże się z jego narkotykową przeszłością, czy z nowym życiem w organizacji, która może wyłudzać od ludzi ich życiowe oszczędności. Gościnnie występuje Roger Bart jako Ethan Kendrick, wysoko postawiony agent IRS, który przygląda się finansom sekty. Tymczasem uniwersytet nagradza badania Pierce’a.

Pierce zostaje wezwany do pomocy FBI w śledztwie w sprawie zamordowania terapeuty. Moretti spędza więcej czasu z profesorem Hathawayem (Jamie Bamber). Dziekan Haley (LeVar Burton) używa Pierce’a jako przynęty na wdowę po zamożnym absolwencie (Krista Allen), chcąc, aby ufundowała nowy budynek.

Pierce musi zastanowić się nad swoim życiem, kiedy zostaje mu przydzielona sprawa, w którą wmieszany jest schizofrenik. Tymczasem Moretti nie powstrzyma się przed niczym, aby zaimponować swojemu nowemu szefowi w FBI. Gościnnie występuje Tom Sizemore, grający wysoko postawionego, irlandzkiego gangstera.

Moretti i Pierce muszą wytropić przestępcę na swoim terenie. Na uczelni, we własnym pokoju zostaje zamordowany student. Pierce zostaje postawiony w niezręcznej sytuacji, która zmusza go do rozważań na temat jego własnej przeszłości. Tymczasem Moretti postanawia przeanalizować swoje relacje z profesorem Hathawayem. W odcinku gościnnie występuje Jamie Bamber.

Pierce dostaje cynk od byłego studenta (w tej roli gościnnie Freddy Rodriguez) o potencjalnym spisku, mającym na celu zatuszowanie morderstwa amerykańskiego senatora. Sytuacja szybko przeistacza się w koszmar. Okazuje się, że ludzie, którym Daniel powinien ufać, prawdopodobnie działają na jego niekorzyść.

Moretti dowiaduje się, że w spiskowej teorii Pierce’a może być ziarno prawdy, kiedy nowe dowody pojawiają się w Internecie. W międzyczasie nowy lekarz Pierce’a zmusza go do zmierzenia się z prawdą dotyczącą Natalie. W odcinku gościnnie występują Freddy Rodriguez i Jimmy Bennett.

Agentka FBI Kate Moretti prosi dr. Daniela Pierce’a, żeby określił umysłowe kompetencje człowieka, który po raz drugi stanie przed sądem za morderstwo. Jednak podczas procesu dochodzi do szokującego i niespodziewanego zwrotu, gdy odkrycia Pierce’a nasuwają pytanie, czy osoba stająca przed sądem jest tym samym człowiekiem, którym była sześć lat temu. Tymczasem Moretti jest niemile zaskoczona, odkrywając, że zastępca prokuratora generalnego oskarżający w procesie to jej już wkrótce były mąż Donnie Dyan (gościnnie Scott Wolf).

Pierce i Moretti zajmują się sprawą natury pozaziemskiej, gdy kobieta zgłasza, że obcy porwali jej męża. Jednakże gdy Pierce i Moretti przybywają na miejsce w celu przeprowadzenia czynności śledczych, dokonują zaskakującego odkrycia. Tymczasem w stosunkach Pierce’a z jego przyjaciółką z realnego życia, Caroline, robi się coraz goręcej, ale jego związek może być zagrożony, o ile nie wyrzuci z umysłu swojej wymyślonej dziewczyny Natalie.

Gdy dochodzi do serii dziwnych, publicznych morderstw, Pierce zdaje sobie sprawę, że zabójca stara się przekazać wiadomość dotyczącą niewidzenia pozauwagowego, ale Donnie wątpi w jego teorię. Jednak Pierce ma asa w rękawie, który może potwierdzić jego przypuszczenia. Muszą się zatem przepychać, żeby poskładać razem wskazówki, zanim sprytny zabójca zrobi więcej przykładów z niewinnych ofiar.

Pierce akceptuje zaproszenie od uznanej aktywistki na rzecz środowiska naturalnego do pracy nad sprawą, która dotyczy łańcucha nienormalnych reakcji neurologicznych w grupie młodych dziewcząt. Jednakże po ich przebadaniu, Pierce odkrywa, że źródłem ich dolegliwości jest pewien mroczny sekret. Tymczasem Moretti kwestionuje motywy Pierce’a odnośnie pracowania bez niej nad sprawą.

Pierce i Moretti zagłębiają się w wirtualną rzeczywistość, chcąc rozwiązać zagadkę morderstwa Kurta Simpsona, człowieka, który spędzał większość swojego czasu na rozbudowanej grze internetowej z udziałem wielu zawodników, o nazwie „Kalejdoskop”. Po utworzeniu swojego awatara, w celu wyśledzenia zbrodni, Pierce zmaga się bardziej niż zwykle z rozróżnieniem rzeczywistości i fantazji.

Nowe urządzenie przeznaczone dla mózgu, mające kontrolować drgawki, wydaje się mieć defekt, który okazuje się znacznie poważniejszy niż jedynie usterka techniczna, a Pierce prowadzi śledztwo razem z Donniem. Ich nieprawdopodobny sojusz poddany zostaje próbie, gdy sprawa potęguje się do morderstwa. Tymczasem Lewicki dowiaduje się cennej lekcji na temat chodzenia na randki.

Gdy Moretti przyjmuje zeznania na łożu śmierci, dotyczące morderstwa nastolatki z 1992 roku, wzywa Pierce’a, żeby ten ustalił wiarygodność chorego człowieka. Jednakże sprawa się komplikuje, gdy dr Hutchins (gościnnie Reid Scott), lekarz rzekomego zabójcy, ujawnia, że guz jego pacjenta w tajemniczy sposób zniknął. Pierce i Moretti muszą dokopać się do przeszłości, aby odkryć prawdę, kryjącą się za szokującą serią oczywistych zabójstw.

Pierce prowadzi dochodzenie w sprawie makabrycznego napadu z użyciem noża w szpitalu psychiatrycznym. Kierowany swoją halucynacją Zygmunta Freuda (gościnnie Judd Hirsch), Pierce zaczyna być przekonany, że szpital pełen jest mrocznych sekretów.

Donnie (gościnnie Scott Wolf) stara się pomóc bohaterce wojennej, która cierpi z powodu zaburzenia neurologicznego, ale co zaczyna się jako dobry uczynek, kończy się poważnymi konsekwencjami. Tymczasem Pierce zostaje kompletnie zaskoczony, gdy pojawia się jego dawna znajoma, z którą kiedyś przeżył szaloną przygodę.

Moretti staje w obliczu zarzutów oskarżenia po tym, jak bierze sprawy w swoje ręce pracując nad niebezpieczną sprawą. Pierce i Donnie (gościnnie Scott Wolf) usiłują oczyścić jej imię, ale w miarę jak pojawiają się sprzeczne dowody, nawet Kate zaczyna kwestionować swoją niewinność.

Z pomocą swojej halucynacji, sławnego baseballisty Mordecaia „Trzy Palce” Browna (gościnnie Brad Beyer), Pierce walczy o autystycznego nastolatka podejrzanego o morderstwo. Tymczasem dziekan Haley używa swojego uroku osobistego w celu przekonania geniusza badań układu nerwowego (gościnnie Kenny Ridwan) do wstąpienia na jego uczelnię.

Pierce i Lewicki są kompletnie zaskoczeni, gdy bez zapowiedzi pojawia się brat Lewickiego, Kenny (gościnnie Chris Meyer). Wskutek niepożądanego splotu wydarzeń Kenny staje się głównym podejrzanym w sprawie morderstwa, przez co Pierce czuje się rozdarty pomiędzy pomocą przyjacielowi a służeniem sprawiedliwości. Tymczasem Lewicki dostaje kuszącą ofertę, która sprawia, że zaczyna kwestionować lojalność Pierce’a.

Po tym, jak Pierce dostaje cynk, że CIA dokonuje zamachów na życie amerykańskich obywateli, narasta napięcie pomiędzy CIA i FBI. Sprawy komplikują się jeszcze bardziej, gdy bliscy przyjaciele Pierce’a zostają zamordowani. Tymczasem Moretti stara się pokonać problemy z zaufaniem do Donniego.

Stabilność psychiczna Pierce’a zaczyna być kwestionowana, a jego praca zagrożona, gdy zostaje posądzony o prześladowanie swojej byłej dziewczyny, Caroline Newsome. W miarę, jak sytuacja ulega nasileniu, Moretti usiłuje znaleźć prawdziwego prześladowcę z pomocą odwiedzającego FBI inspektora z Kanady.

Z pozoru idealne nowe życie dr. Daniela Pierce’a w Paryżu zostaje nagle wywrócone do góry nogami po tym, jak zwraca się do niego wysłannik FBI, prosząc o pomoc przy niebezpiecznej, międzynarodowej sprawie. Tymczasem jego asystent Max Lewicki oraz dziekan Paul Haley knują, jak ściągnąć Pierce’a z powrotem do Chicago.

Gdy pani prokurator w tajemniczy sposób pada martwa na środku sali sądowej, Pierce i Moretti wyruszają na poszukiwania mordercy. Tymczasem Moretti i Donnie podejmują decyzje na temat wspólnej przyszłości.

Po tym, jak młoda ofiara, cierpiąca na wady rozwojowe, zostaje wzięta na zakładnika podczas napadu na bank, Moretti ściąga Pierce’a, by przesłuchał chłopca. Gdy w końcu udaje im się wytropić sprawców, okazuje się, że w tej sprawie chodzi o wiele więcej niż pieniądze. Tymczasem dawno niewidziany ojciec Pierce’a, James (gościnnie Peter Coyote), składa mu wizytę.

Moretti wzywa Pierce’a, aby przebadał Elenę Douglas (gościnnie Rya Kihlstedt), kobietę, która przyznała się do morderstwa i twierdzi, że jest opętana przez diabła. Tymczasem weselne plany Donniego i Moretti trafiają na przeszkodę.

Gdy uznany neurobiolog, Landon Jennings, zostaje znaleziony martwy, Moretti i Pierce muszą dowiedzieć się, jak ktoś mógł uzyskać dostęp do jego nieprzeniknionego studia, żeby go zabić. Lewicki ma podwójną ilość roboty, od momentu, gdy wprowadza się do nich ojciec Pierce’a – James (gościnnie Peter Coyote).

Zgłoszone zostaje uprowadzenie dziecka. Moretti namierza porywacza i dokonuje dziwacznego odkrycia. Gdzie indziej Pierce i Moretti badają pokrewne morderstwo, a Donnie wyrusza, by kupić dom na przedmieściach.