Kapitan Flint stawia czoło buntowi własnej załogi. John Silver ukrywa rzecz o wielkiej wartości. Eleanor utrzymuje porządek na wyspie New Providence, podczas gdy Królewska Marynarka Wojenna rośnie w siłę.
Kapitan Flint demaskuje złodzieja wśród załogi, a Jack Rackham przezwycięża obiekcje kapitana Vane’a. John Silver ukrywa się z Maxem w domu publicznym, podczas gdy Eleanor musi dokonać niemożliwego wyboru.
Flint i Gates (Mark Ryan) usiłują zdobyć dodatkową pomoc w poszukiwaniu Urca d'Lima. Silver i Billy (Tom Hopper) starają się zwiększyć morale załogi. Eleanor jest pod wrażeniem wyczynów Vanea. Gates otrzymuje awans.
Załoga Walrusa cierpi z powodu katastrofalnego w skutkach zobowiązania. Flint otrzymuje ostrzeżenie dotyczące Billyego. Eleanor prosi o pomoc ojca. Vanea (Zach McGowan) odwiedza osoba z jego przeszłości.
Kapitan Flint gra z załogą „Morsa” w śmiertelne szachy na otwartym morzu, a Richard zmusza Eleanor do zgody na małżeństwo. Tymczasem Jack Rackham uznaje, że przyszła pora na zmianę w życiu zawodowym.
Pościg za Andromache okazuje się kosztownym przedsięwzięciem. Eleanor (Hannah New) potrzebuje pomocy Silvera (Luke Arnold). Billy (Tom Hopper) uważa, że Gates (Mark Ryan) powinien wyzwać kapitana Flinta (Toby Stephens). Bonny (Clara Paget) zajmuje stanowisko.
Trwa polowanie na Urcę. W życiu Eleanor Guthrie (Hannah New) następuje zmiana. Anne Bonny (Clara Paget) i Jacka Rackhama (Toby Schmitz) nawiedzają grzechy przeszłości.
Flint i Silver są sądzeni za popełnione przestępstwa. Vane rozkoszuje się nową posadą w forcie, a Eleanor ma problemy z utrzymaniem kontroli nad Nassau.
Flint wciela w życie swój plan, dając wskazówkę Dufresnemu. Silver wkrada się w łaski załogi, opowiadając soczyste plotki, a Meeks prosi Eleanor o przysługę.
Eleanor maksymalnie angażuje się w negocjacje pokojowe, ale Vane stawia jej ultimatum. Billy wraca z ostrzeżeniem. Bonny traci kontrolę i poddaje się szaleństwu.
Billy pokazuje, jak bardzo się zmienił. Przygnębiająca wiadomość z lądu powoduje rozłam między Flintem a Silverem. Między Eleanor i Vane’em dochodzi do starcia.
Flint i Miranda przygotowują się do negocjacji z lordem Ashem. Silver opowiada załodze pouczającą historię. Vane przekracza granicę, zmuszając Eleanor do reakcji.
Eleanor ujawnia swoje bezwzględne oblicze. Flint i Miranda muszą stawić czoło swojej przeszłości. Anne nie kryje swoich zamiarów przed Jackiem, gdy stawiają żagle.
Gdy kapitan Flint oczekuje na proces, z pomocą przychodzi mu niespodziewana para. Załoga Vane’a podejmuje decyzję, w wyniku której kucharz Silver stanie się legendą.
Po spaleniu przez piratów Charles Town Flint próbuje sobie poradzić ze stratą Mirandy Barlow. Rozpacz pcha go w stronę krwawej i bezlitosnej kampanii terroru w całym Nowym Świecie. Przed całkowitym zatraceniem się w brutalności i szaleństwie ratuje go John Silver. Tymczasem w Nassau miejsce uwięzionej Eleanor Guthrie zajmuje Jack Rackham, który dzięki hiszpańskiemu złotu może w końcu zapewnić sobie reputację i sojuszników, w tym Charlesa Vane'a.
Sytuacja zmienia się wraz z pojawieniem się na wyspie Edwarda Teacha, zwanego Czarnobrodym. Jeden z najsławniejszych piratów w historii nie może pogodzić się z tym, jak sukces i pieniądze rozleniwiły dawnych piratów. Jednak największym zagrożeniem dla Nassau jest Woodes Rogers, który przybywa na wyspę z zamiarem jej podbicia i przyłączenia do Anglii. Rogers zrobi wszystko, by pokonać i upokorzyć piratów.
Uwięziona na morzy przez flautę, załoga kapitana Flinta walczy o przetrwanie. Brak jedzenia i wody doprowadza do kulminacji konfliktu między Flintem a Silverem. Nassau pod przywództwem Jacka Rackhama przygotowuje się do brytyjskiej inwazji.
Powracająca do Nassau cywilizacja kieruje swoją uwagę w stronę Vanea. Flint, Silver i Billy spotykają nowego wroga. Tymczasem Rackham zajmuje stanowisko, z którym nie zgadza się jego załoga, natomiast Scott znajduje swoje miejsce pod nowymi rządami.
Stojąc w obliczu śmierci, Silver zmusza Flinta do podjęcia działań mających ich uratować. Tymczasem Teach pokazuje Vaneowi nową drogę, natomiast Eleanor i Rogers napotykają na kolejne zagrożenie.
Flint nie zgadza się z wizją Teacha dotyczącą przyszłości piractwa. Rogers dokonuje aresztowania. Tymczasem Rackham znajduje nowy cel, natomiast Madi postanawia pomóc Silverowi.
Flint i Silver wracają do Nassau. Zmiana warunków stawia Rackhama i Bonny w niebezpieczeństwie. Tymczasem misja Vanea nadal się rozwija, natomiast Eleanor zwierza się Rogersowi.
Rogers zostaje zaatakowany podczas transportowania więźnia. Na pokładzie Walrusa dochodzi do walki. Tymczasem Silver i Madi zostają poddani testowi, natomiast Billy widzi dla siebie nową rolę w zbliżającej się bitwie.
Flint i Silver prowadzą walkę o odzyskanie Nassau. Tymczasem Jack i Czarnobrody obmyślają plan zemsty na swoich wrogach. Eleanor próbuje pogodzić się z jej nowymi obowiązkami.