Po spędzeniu dzieciństwa w klasztorze nastoletnia Maria Stuart przybywa do Francji, gdzie zostaje wysłana dla zapewnienia Szkocji politycznego sojuszu poprzez małżeństwo z synem francuskiego króla Henryka II, Franciszkiem.

Maria chcąc przekonać królestwo Anglii o trwałości swojego sojuszu z Francją, chce żeby Franciszek namówił króla Henryka do ogłoszenia jej zaręczyn z Franciszkiem. Tymczasem królowa Katarzyna dowiaduje się o świadku, który może opowiedzieć o jej zbrodniach.

Anielska armia przekracza szkocką granicę. Maria prosi o pomoc króla Henryka, ten jednak odmawia. Tymczasem Tomas, nieślubny syn króla Portugalii obiecuje Marii pomoc w walce z Anglią pod warunkiem, że odwoła ona swoje zaręczyny z Franciszkiem i przyjmie jego oświadczyny.

Maria musi zdecydować, czy skazać na śmierć człowieka, jeśli dzięki temu król Henryk odwoła jej zaręczyny z Franciszkiem. Tymczasem Franciszek i Bash są podejrzliwi co do prawdziwych zamiarów Tomasa. Ich podejrzenia doprowadzają do konfrontacji mającej katastrofalne skutki.

Na dwór przybywa była kochanka Franciszka. Tymczasem królowa Katarzyna przekonuje Aylee do szpiegowania Marii, natomiast Bash wplątuje się w konflikt z heretykami, którzy oskarżają go o zakłócenie ich świętego rytuału.

Królowa Katarzyna podejmuje drastyczne środki, chcąc znaleźć ludzi odpowiedzialnych za próbę nastraszenia Marii. Bash wyrusza do lasu, chcąc spłacić swój dług wobec heretyków. Tymczasem Kenna przyznaje się do romansu z królem.

Maria i Franciszek zostają zmuszeni do zaufania sobie nawzajem kiedy zamek zostaje zajęty przez napastników. Królowa Katarzyna szokuje wszystkich niespodziewaną propozycją, która ma uratować życie wszystkich zakładników. Tymczasem Diane mówi Bashowi o swoich planach.

Nostradamus przepowiada Marii, że jedna z jej dam dworu wkrótce zginie. Z powodu tej przepowiedni królowa podejmuje trudną decyzję, która na zawsze zmieni jej związek z Franciszkiem. Tymczasem Kenna wyjawia Katarzynie plany Diane dotyczące Basha.

Maria i Bash zostają schwytani i zmuszeni do powrotu do zamku. Tymczasem królowa Katarzyna z jeszcze większą determinacją stara się zniszczyć miłość Marii i Franciszka, natomiast Franciszek dowiaduje się o przepowiedni Nostradamusa.

Królowa Katarzyna jest podejrzana o przeprowadzenie zamachu na życie Basha. Maria postanawia uwolnić z celi niewinnie oskarżoną ciężarną dziewczynę, która ma tajemnicze powiązania z Bashem. Tymczasem Lola szantażuje królową Katarzynę chcąc powstrzymać ją przed zniszczeniem Marii i Basha.

Po powrocie z Rzymu Król Henryk oskarża królową Katarzynę o cudzołóstwo i skazuje ją na śmierć. Katarzyna dowiaduje się o dziecku Isobel i dzięki tej informacji ma zamiar zniszczyć Basha. Tymczasem Maria i Bash odkrywają, że wiele lat temu Katarzyna miała romans z przyjacielem króla, Richardem Delacroix i informują o tym Henryka.

Kiedy Clarissa porywa dwóch młodszych synów Henryka i Katarzyny, Maria i Bash łączą siły z królową i wspólnie próbują odnaleźć chłopców zanim dojdzie do tragedii. Tymczasem Lola usiłuje pomóc swojemu bratu w wyjściu z długów.

Maria musi zdecydować czy chce poślubić Franciszka czy Basha, biorąc pod uwagę zarówno potrzeby Szkocji jak i swoje własne. Podjęcie decyzji staje się dla niej jeszcze trudniejsze kiedy na dwór królewski powraca Franciszek. Tymczasem do Francji przybywa matka Marii, która ma własne plany co do przyszłości córki.

Dwa miesiące po ślubie Maria i Franciszek wracają na dwór. Po ich powrocie na światło dzienne zaczynają wychodzić sekrety, które mieli nadzieję na zawsze pogrzebać. Tymczasem króla Henryka i królową Katarzynę ponownie łączy przelana krew.

Podczas gdy kobiety przebywające na dworze oceniają potencjalnych zalotników, Lola niechętnie bierze udział w tych praktykach. Tymczasem po kolejnym incydencie z udziałem króla Henryka, Kenna zaczyna obawiać się o swoje bezpieczeństwo.

Franciszek niechętnie zgadza się pomóc Bashowi w odkryciu zagrożenia czającego się w lesie. Tymczasem szaleństwo króla Henryka doprowadza do coraz większego chaosu na dworze, natomiast Greer zostaje przyłapana w trakcie pocałunku z Leithem.

Maria odkrywa sekretną klauzulę dodaną do kontraktu ślubnego przez jej matkę i królową Katarzynę. Maria i Franciszek usiłują przekonać szkockich arystokratów żeby odwołali Marię de Guise ze stanowiska regentki.

James, przyrodni brat Marii, przyjeżdża do Francji i zaczyna namawiać królową do powrotu do Szkocji. Podejrzliwy Franciszek odkrywa spisek mający zniszczyć jego żonę. Tymczasem Lola odkrywa prawdziwy powód oświadczyn Juliena.

Maria i Franciszek zostają zmuszeni do dokonania trudnego wyboru pomiędzy Szkocją, Francją i swoim małżeństwem. Tymczasem na dwór przybywa wuj Marii ze złymi wieściami dotyczącymi Marii de Guise, natomiast król Henryk dokonuje złego wyboru.

Maria werbuje do pomocy najemników, co zmusza ją do uświadomienia sobie jak wiele jest wstanie poświęcić dla swojego kraju. Tymczasem Franciszek dowodzi francuską armią w brutalnej bitwie przeciwko Anglikom.

Obawiając się o życie Franciszka, Maria postanawia pomóc królowej Katarzynie w pozbyciu się szalonego króla Henryka. Tymczasem Bash znajduje chłopca, który przeżył spotkanie z ciemnością, natomiast Julien odkrywa przed Lolą prawdziwe motywy swoich działań.

Król Henryk postanawia zabić Franciszka, żeby po jego śmierci ożenić się z Marią. Franciszek, Katarzyna i Maria urządzają turniej rycerski. Tymczasem Lola zaczyna rodzić, a ciemność wraca po Pascala.

Wybucha epidemia dżumy i zamek zostaje zamknięty, aby nie dopuścić choroby do środka. Niestety zarażeni już się tam znajdują. Tymczasem Franciszek nie zgadza się na pozostanie w zamku i wyrusza do wioski, w której Lola rodzi jego syna. Maria zostaje postawiona przed dużym dylematem: jeden ze szlachciców rząda zamordowania swojego wroga albo zablokuje dostawy zboża do zamku.

Gdy ciała są grzebane po zarazie, a Franciszek i Lola bezpiecznie docierają do zamku w towarzystwie nowo poznanego przyjaciela: Louisa Condé, pojawia się Lord Narcisse i odkrywa, że to Maria zabiła jego syna, wtrącając go do katakumb z zarażonymi ludźmi. Nie pomagają wyjaśnienia, że była to kara za zabicie całej niewinnej rodziny. Lord Narcisse rząda zabicia Nostradamusa, który postawił fałszywą diagnozę o chorobie jego syna. Franciszek zmaga się z decyzją czy uznać syna Loli za swojego. Kenna namawia Sebastiana, aby wymógł na Franciszku oficjalne stanowisko na dworze. Dodatkowo okazuje się, że brama między światem żywych i martwych została otwarta przez zarazę.

Francja głoduje po zarazie, a szlachta nie chce dać koronie zboża w obawie przed zemstą Lorda Narcisse'a, który również sam uchyla się od tego obowiązku. Maria znajduje sojusznika - Niemcy, które są gotowe dostarczyć Francji zboże w zamian za uwolnienie protestanckich więźniów. Franciszek jest zajęty sprawą niani, którą opętał duch jego ojca - króla Henryka. Sebastian zmaga się ze swoją nową pozycją, która okazuje się niebezpieczna.

Cały dwór planuje chrzciny dziecka Loli i Franciszka. Tymczasem Maria oznajmia, że sama jest w ciąży. Lola chce pomóc nowej żonie Lorda Narcisse'a - Estelle, uciec od jej męża. Greer podejmuje wreszcie trwałą decyzję z kim chce być: Leith czy Lordem Castleroyem. Sebastian bada sprawę tajemniczych jeźdźców, którzy znaczą ludzi i rzekomo zabierają ich dusze.

Napięcia pomiędzy katolikami i protestantami stają się coraz większe. Siostrzeniec Louisa Condé zostaje zamordowany po udziale w spotkaniu protestantów, w którym również brał udział Lord Castleroy. Franciszek wciąż jest dręczony przez nianię, rzekomo opętaną przez ducha jego ojca. Kenna znajduje seksualny pamiętnik jednej z dam dworu, w którym opisuje wspaniałego kochanka ze znamieniem w kształcie motyla. Lola i Kenna próbują go zidentyfikować.

Powóz Marii i królowej Katarzyny zostaje napadnięty i obie królowe muszą uciekać i udawać, że nie należą do rodziny królewskiej. Lola zostaje wydziedziczona przez swoją rodzinę za bycie kochanką króla i stara się odzyskać posag, który dostał od jej rodziny jej zmarły mąż. Nieoczekiwanie swoją pomoc oferuje jej Lord Narcisse. Maria i Katarzyna natykają się na grupę podszywającą się pod rodzinę królewską.

Na dwór powraca siostra Franciszka - młoda i rozpieszczona księżniczka Claude. Lord Narcisse szantażuje króla Franciszka do podpisania dekretu potępiającego protestantów. Franciszek próbuje namówić Lolę do podłożenia dowodu pogrążającego Narcisse'a.

Po podpisaniu traktatu przez Franciszka, protestanci są torturowani w imię katolicyzmu. Maria nie może przebaczyć tej decyzji Franciszkowi, gdyż nie wie nic o szantażu lorda Narcisse'a. Franciszek próbuje ją zrazić do siebie, by wyjechała do Szkocji, gdzie będzie bezpieczna. Królowa Katarzyna widzi duchy swoich zmarłych córek, które grożą życiu księżniczki Claude, na której ciąży mroczny sekret. Protestanci grożą królowi wybuchem bomby.