Ghost in the Shell jest adaptacją mangi autorstwa Masamune Shirowa. Akcja rozgrywa się w roku 2029, w świecie, w którym komputery są wszechobecne. Wraz z ich ekspansją zmieniła się definicja przestępstwa. Teraz najgorszą zbrodnią jest włamywanie się do sieci. Aby temu zapobiec, powołano specjalny oddział Sekcja 9, składający się z cyborgów mających dostęp do sieci z każdego miejsca na Ziemi. Ghost in the Shell opowiada o poszukiwaniach przez parę agentów groźnego hakera ukrywającego się pod pseudonimem "Władca marionetek"...
Sekretna wiadomość sprawia, że brytyjski agent James Bond dowiaduje się o istnieniu złowrogiej organizacji. Ponieważ M zmuszony jest toczyć polityczną bitwę, w której stawką jest przyszłość tajnych służb, Bond w walce z potężną organizacją może liczyć głównie tylko na siebie.
Pewnego dnia osiem nieznanych sobie wcześniej osób budzi się w labiryncie pomieszczeń przypominających sześcian. Inżynier Jerry, piękna Kate, pułkownik Maguire, nożownik Simon, niewidoma Sasha, emerytowana nauczycielka Paley, prawniczka Julia oraz podejrzliwy programista Max nie pamiętają, w jaki sposób tam trafili. Wkrótce dochodzą do wniosku, że zostali uwięzieni w teserakcie - sześcianie umieszczonym w czterech, a nie w trzech wymiarach.
W niedalekiej przyszłości wszechwładna korporacja powierza szalonemu geniuszowi komputerowemu zadanie udowodnienia przełomowego twierdzenia matematycznego.
Tajne służby mogą teraz liczyć tylko na niego – Johnny’ego Englisha. Niedawno zdegradowany, prowadzi zajęcia w jednej ze szkół. To właśnie wtedy zostaje ponownie powołany na dawne stanowisko, by zdekonspirować przebiegłego hakera, który zagraża bezpieczeństwu państwa. Ale aby misja się udała, Johnny będzie musiał użyć wszystkich swoich umiejętności, cóż, w każdym razie tych, które ma. „Analogowymi” metodami, które zna ze swej młodości, będzie musiał stawić czoła digitalnej technologii jutra.
Rok 2021. Johnny Mnemonic (Keanu Reeves) ma w głowie umieszczony implant, w którym przemyca dane wykradzione pewnej korporacji. Musi w ciągu czterdziestu ośmiu godzin pozbyć się tej cennej przesyłki. W innym razie wskutek przeładowania mózgu danymi grozi mu śmierć. W zasadzce przygotowanej przez mafię zginęli jego pracodawcy i został zniszczony „wyzwalacz” zapisanych w mózgu informacji. Johnny’emu pomaga Jane (Dina Meyer).
Na tydzień przed swoim ślubem Ben (Kevin Hart) wyrusza do Miami wraz ze swoim przyszłym szwagrem Jamesem (Ice Cube). Razem chcą dorwać niebezpiecznego dilera narkotyków, który zaopatruje tym towarem całą sieć dilerów Atlanty.