Kyon jest zwykłym uczniem szkoły średniej. Nie wierzy w nadprzyrodzone zjawiska. Tym bardziej jest więc zaskoczony, kiedy jego sliczna koleżanka z klasy - Haruhi - oświadcza przed całą klasą, że nie interesują jej "normalni ludzie", tylko podróżujący w czasie, kosmici i inni dziwacy. Zaciekawiony Kyon zaprzyjaźnia się z Haruhi i staje się wkrótce członkiem jej klubu - Brygady SOS - powołanej w celu badania zjawisk nadprzyrodzonych. Wraz z Haruhi i innymi, nieco osobliwymi członkami klubu, przeżywa od teraz najzabawniejsze przygody...