Josh ciągle gra w Biotic Wars, niemożliwą do przejścia grę. Ale gdy w końcu mu się udaje, pojawiają się tajemniczy goście z przyszłości. Świat jest w niebezpieczeństwie, a Josh jest jedyną osobą, która może go uratować.
W 1969 roku Josh, Tiger i Wolf rozpoczynają misję zinfiltrowania imprezy bractwa i powstrzymania dr Kronisha przed zarażeniem się opryszczką - ale zniszczenia, które po sobie pozostawiają, szybko ich doganiają.
Tiger i Wolf decydują, że nadszedł czas, aby dr Kronish zginął. Josh niechętnie zgadza się pomóc - ale kiedy zdaje sobie sprawę, że nie może tego zrobić, znajduje się na celowniku Tiger i Wolfa.
W następstwie katastrofalnej próby zabójstwa dr Kronisha, Tiger i Wolf wyrzucają Josha z misji. Kiedy zdają sobie sprawę, że ich urządzenie do podróży w czasie jest uszkodzone, Josh dobija targu.
Tiger, Wolf i Josh pracują nad zdemaskowaniem Biotics na przyjęciu bożonarodzeniowym w Kronish Labs. W międzyczasie Josh zbliża się do swojej współpracowniczki Jeri, która pomaga mu uniknąć obsesyjnego policjanta.
Mając zaledwie dwadzieścia siedem minut przed wybuchem bomby w głowie schwytanego przez nich Biotica, Josh, Tiger i Wolf prowadzą przesłuchanie w sypialni Josha.
Josh, Tiger i Wolf skaczą w przyszłość, aby ukraść paliwo, którego desperacko potrzebują, aby kontynuować swoją misję. Ale kiedy docierają do celu, stają twarzą w twarz z nieoczekiwanym wrogiem.
Koniec misji jest bliski, a Tiger i Wolf przygotowują się do ostatniego skoku w przeszłość. Ale kiedy mama Josha zostaje porwana, Josh nie pozwala Tiger i Wolfowi odejść, zanim nie zorganizują śmiałej akcji ratunkowej.
Przekonany, że wie, jak raz na zawsze powstrzymać doktora Kronisha, Josh przejmuje TTD i prowadzi zespół na misję w przeszłość. Ale kiedy Wolf znika, muszą się rozdzielić.
W przeszłości Josh desperacko próbuje zmienić przyszłość dr Kronisha, jednocześnie nie psując własnej. W międzyczasie Tiger i Wolf konfrontują się ze sobą w związku z chwiejnym oddaniem Wolfa dla sprawy.
Rozdarty wewnętrznymi podziałami zespół jest rozproszony po całej historii, podczas gdy Tiger i Wolf liczą się z tym, jak misja ich zmieniła i że mogą ponieść porażkę.
Josh odkrywa, że jego ingerencja w przeszłość całkowicie zmieniła jego życie... na lepsze. Wolf i Tiger radzą sobie z następstwami nieudanej misji w przeszłość.
Nie mając czasu i możliwości, bohaterowie godzą się z faktem, że ich działania znacznie pogorszyły sytuację i planują ostatnią misję, aby raz na zawsze położyć kres doktorowi Kronishowi.
Tiger i Wolf przybywają do stworzonej przez siebie przyszłości. Tiger dowiaduje się, że ludzkość przenosi się na Marsa, jej DNA stworzyło lekarstwo, a Stu Camillo żyje i ma się dobrze w formie hologramu.
Wolf zostaje pomylony z Torquem (Wilkiem w tej linii czasowej) i postanawia z tego skorzystać. Dowiaduje się o New Above Ground, jego sześcioosobowych rodzinach i nienawiści do technologii.
Podczas gdy Tiger poznaje swojego sobowtóra Ty-Anne, Wolf aklimatyzuje się w NAG, a Josh błąka się po pustyni. Josh zostaje przywieziony do NAG i skazany na przymusową służbę jako niszczyciel technologii.
Josh, Tiger i Wolf wyruszają na misję odnalezienia TTD. Josh odkrywa, że nie jest jedynym Joshem w 2162 roku, ale Athena ucieka z TTD. Tiger przysięga, że będzie ją ścigać - sama.
Ignorując ostrzeżenia, Wolf sprowadza Josha, by zamieszkał w pobliżu. Tiger dociera do ślepego zaułka w swoich poszukiwaniach TTD. Wolf odkrywa prawdę o Tiger.
Stu wysyła komandosów, by porwali Josha w NAG - dochodzi do chaosu i rozlewu krwi. Wolf zdaje sobie sprawę, że Stu jest zły i szuka zemsty, na próżno próbując przekonać Tiger do prawdy.
Ty-Anne dzieli się swoją historią zostania Achillesem, zaczynając od tego, że była dzieckiem spragnionym miłości, której Stu nigdy nie mógł dać, a kończąc na misji ze swoim byłym kochankiem.
Josh, Tiger i Wolf, którzy zbyt wiele razy bawili się podróżami w czasie, lądują w więzieniu w roku 3491. W obliczu wyroku śmierci za popełnione przestępstwa, ich lojalność wobec siebie zostaje wystawiona na próbę.
Uciekając do kanadyjskiej dziczy w 1627 roku, Wolf chce pomóc wyleczyć ranną nogę - i duszę - Josha. Tiger obiera sobie za cel mitycznego białego niedźwiedzia.