Dwunastoletni chłopiec Mahito traci matkę w wyniku nalotu na Tokio podczas wojny w 1943 roku. Po jej śmierci ojciec kupuje fabrykę amunicji lotniczej i żeni się z Natsuko, młodszą siostrą swojej zmarłej żony. Niestety wkrótce cała rodzina zmuszona jest do ucieczki na wieś. Młody chłopak ma trudności z przystosowaniem się do życia w nowym miejscu. Wciąż zmaga się ze śmiercią matki, jest prześladowany w szkole, a jego relacja z Natsuko jest stresująca, gdyż kobieta jest w ciąży i spodziewa się dziecka. Mahito spotyka również tajemniczą szarą czaplę, która regularnie go dręczy.