Współczesne społeczeństwo jest zagubione, gdy tajemnicze światło zamienia ludzkość w kamień. Tysiące lat mija, a uczniowie liceum, Senku i Taiju, budzą się w zarośniętej dziczejącą roślinnością wersji świata, którą kiedyś znali. Z Senku jako mózgiem i Taiju jako siłą, są zdeterminowani, aby ożywić zastygłe masy i odbudować cywilizację—ale jeden z tych, których uratowali, Tsukasa, zburzy ich plany.