Niezwykle uzdolniony Arata Kasuga dołącza do Akademii Biblii, by nauczyć się magii i uwolnić swoją kuzynkę Hijiri uwięzioną w innym wymiarze. Jego nauczycielkami zostaje siedem dziewcząt, tworzących tytułowe "Trinity Seven". Razem przyjdzie im pokonać wiele problemów i magicznych przeciwników, jak również przeżyć sporo komicznych sytuacji o lekkim zabarwieniu erotycznym.
Arata Kasuga wiedzie życie typowego nastolatka wraz ze swoją kuzynką Hijiri. Pewnego dnia chłopak odkrywa, że świat jaki zna nie istnieje a on za sprawą magii stworzył sobie jego imitację. Nie mając innego wyjścia dołącza do szkoły magii.
Arin postanawia przetestować moce Araty, tworząc barierę energetyczną wokół swojego pokoju. Gdy udaje mu się uwolnić sprawia, że chłopak uwalnia swój pełny potencjał, usuwając ograniczenia, jakie nałożył na niego Grimoire.
Arata uczy sie nowej umiejętności dzięki czemu przełamuje czar zniszczenia. Uszkodzenia szkoły są jednak poważne i uczniowie zostają wysłani na tropikalną wyspę, gdzie chłopak doskonali swoje umiejętności pod okiem dziewczyn.
W szkole dochodzi do kolejnego magicznego fenomenu i wszyscy uczniowie zapadają w sen. Akio i pozostałe dziewczyny wyruszają do podziemi, by odszukać zaginioną Yui, która może za wszystko odpowiadać.
Dziewczyny zaczynają rywalizować o względy Araty. Jakiś czas później kolejny fenomen przenosi grupę do wymiaru Wiecznej biblioteki, gdzie spotykają siostrę Seliny.
Lieselotte przejmuje moc Araty, ale przegrywa walkę, gdyż nie do końca potrafi ją kontrolować. Grupa wraca do swojego świata, czekając na jej kolejny atak.
Liselotte atakuje szkołę, mając do dyspozycji moce Araty. W tym samym czasie chłopak trenuje, by znaleźć sposób na jej powstrzymanie. Pomaga mu w tym jego grymuar, który przyjmuje postać Sory.
Decyzją dyrektora Arata dołącza do grupy, mającej zbadać jedną ze szkół magii, gdzie doszło do pojawienia się kolejnego fenomenu. Zanim jednak do tego dojdzie czeka go kilka ciężkich lekcji.
Arata, Sora i Mira zostają uwięzieni w objętej barierą szkole, będącą pułapką przygotowaną przez Iliad (kolejny fragment grymuaru). Chcąc się uwolnić muszą odszukać źródło mocy bariery.
Arata przemienia się w Demonicznego lorda ale dzięki mocy Miry i grymuarów wraca do dawnej postaci a całej trójce udaje się wrócić do naszego świata. Niestety na miejscu okazuje się, że będą musieli walczyć z Hijiri.