Niezwykle uzdolniony Arata Kasuga dołącza do Akademii Biblii, by nauczyć się magii i uwolnić swoją kuzynkę Hijiri uwięzioną w innym wymiarze. Jego nauczycielkami zostaje siedem dziewcząt, tworzących tytułowe "Trinity Seven". Razem przyjdzie im pokonać wiele problemów i magicznych przeciwników, jak również przeżyć sporo komicznych sytuacji o lekkim zabarwieniu erotycznym.