Utawarerumono opowiada historię zamaskowanego bohatera Hakuoro. Pewnego dnia zostaje on znaleziony w lesie przez starszą kobietę i jej dwie wnuczki, które zabierają go do swego domostwa. Bohater jest ranny, a gdy okazuje się że ma amnezję kobieta postanawia zaopiekować się nim dopóki się mu nie poprawi. Hakuoro szybko zadomawia się w wiosce, która jak się później okazuje jest uciskana przez władającego nią cesarza. Po pewnym czasie bohater staje na czele rebelii, dzięki czemu zostaje cesarzem kraju zwanego Tusukuru. Niestety bardzo szybko Hakuoro dowiaduje się, że utrzymanie pokoju jest wyjątkowo trudne i wymaga, by nieustannie walczyć w celu ochrony kraju i jego ludu.