Podczas rutynowej kontroli drogowej samochodu ginie policjant. W patrolu towarzyszył mu cywil, który najprawdopodobniej uciekł. Zniknęła też policyjna broń, ale złodziej zostawił odcisk buta. Policjant zdążył przed śmiercią zgłosić numery rejestracyjne kontrolowanego wozu, ale okazują się fałszywe. Mimo to Calleigh ustala markę auta i poszukiwany samochód szybko zostaje zatrzymany. Za jego kierownicą policjanci zastają nastolatkę. Jej zeznania wydają się śledczym mało przekonujące.

Boy hotelowy dostarcza bagaż do pokoju i wkrótce potem ginie. W jednej z walizek, którą dostarczył, śledczy odkrywają arkusze papieru ze znakiem wodnym oraz kosmyk włosów. Jeden z turystów zgłasza zaginięcie żony. Wkrótce jej ciało zostaje odkryte w windzie. Okazuje się, że kobieta zmarła w wyniku reakcji alergicznej. W związku z pierwszą sprawą z Waszyngtonu przylatuje agent FBI Elliott prowadzący sprawę napadu na ciężarówkę przewożącą papier z mennicy. Podczas tego napadu zniknęła równowartość kilku milionów dolarów.

Pracownik ochrony odkrywa zwłoki młodej kobiety. Alexx zastanawia, skąd na jej ciele tak ogromna ilość śluzu i zagadkowe regularne rany kłute. Analiza prowadzi do wniosku, że śluz pochodzi od dużego węża, a rany to jego ukąszenia. W pobliżu miejsca zbrodni Eric i detektyw Tripp odnajdują martwego gada-zabójcę. Szukając odpowiedzi na pytanie, skąd gad znalazł się w Miami, Horatio Caine trafia na Clavo Cruza. Sprawa skradzionej torebki okazuje się o wiele poważniejsza, niż Ryan mógł przypuszczać. Kobieta, która zgłosiła się po jej odbiór, prawdopodobnie wcześniej dopuściła się kradzieży tożsamości.

Ekipa CSI zostaje wezwana na bagna Everglades, gdzie miejscowy strażnik dzikiej przyrody zauważył ciało młodego mężczyzny w paszczy aligatora. Pobieżna sekcja zwłok potwierdza, że zginął on od postrzału śrutem. Nie ma jednak czasu na dokładniejsze przebadanie miejsca zbrodni, gdyż pożar, który wybuchł na bagnach, wymyka się strażakom spod kontroli. Sytuację ma rozładować skierowanie do walki z żywiołem grupy więźniów, ale ich pojawienie się tylko prowokuje konflikty. Wkrótce jeden z kryminalistów, Rico Garza, zostaje znaleziony martwy.

W pobliżu rezydencji, gdzie trwa przyjęcie, rozbił się mały samolot transportowy. Z wraku Horatio wyciąga rannego pilota, który pamięta tylko zielony błysk, po którym stracił kontrolę nad sterami. Nie zważając na to, że trwa śledztwo, właściciel firmy transportowej usiłuje zabrać z miejsca katastrofy worki, którymi przewożone były czeki warte ponad miliard dolarów. Wkrótce okazuje się, że w samolocie znajdowały się jeszcze zwłoki młodej kobiety z jednej z najbogatszych rodzin w mieście, której matka nie zgadza się na sekcję zwłok.

W przewożony lądem jacht wpada na skrzyżowaniu rozpędzony samochód z martwym kierowcą w środku. Kolizja okazuje się próbą zatuszowania morderstwa, ofiara bowiem nie żyje od kilku godzin. Alexx zastanawiają liczne blizny na ciele denata, a najbardziej brak prawej stopy. Wyjaśniając, jakim cudem nieboszczyk nacisnął pedał gazu, Ryan i Calleigh odkrywają, że Jake Sullivan pracował w firmie produkującej gry wideo i testował ich najnowsze produkty.

Od strzału w głowę ginie młody mężczyzna, który próbował ukraść jacht – jak twierdzi właściciel. Horatio zastanawia się, po co była mu kłódka. Okazuje się, że mógł być on funkcjonariuszem rządowym, rekwirującym łódź na poczet niespłaconych długów. Nurkując w kanale portowym, Delko znajduje dowód rozwiązujący zagadkę. Wkrótce potem kolejny agent zostaje znaleziony martwy. Również został zastrzelony, ale ktoś go od jakiegoś czasu podtruwał. Kształt kropli krwi na miejscu zbrodni sugeruje, że ktoś zabrał także coś cennego z jego samochodu.

W nocy zginęła młoda kobieta. Została uduszona poduszką. Nie ma żadnych świadków. Rano Eric orientuje się, że poprzedniej nocy, podczas randki na parkingu z nieznajomą dziewczyną, zgubił swoją służbową odznakę. Zastanawia się, czy została skradziona, bo niedługo potem ktoś podaje się za policjanta i zabija handlarza narkotyków. W pobliżu miejsca strzelaniny Horatio spostrzega mężczyznę skazanego na dożywocie za zabójstwo jego brata.

Cheri Lyle przekonuje Calleigh do swoich racji. Brad stanowczo odpiera zarzut molestowania. Mężczyzna obawia się, że sędzia przychyli się do wersji byłej żony. Badania DNA ujawniają, że Brad nie jest biologicznym ojcem dziewczynki. Horatio zaczyna podejrzewać, jakie prawdziwe motywy kierują parą skłóconych rodziców. Eric i Alexx rozpoczynają śledztwo w nowej sprawie, która początkowo wygląda na samobójstwo. Badania DNA przynoszą zaskakujące rezultaty. Obie sprawy łączą się.

Na spotkaniu absolwentów zostaje zamordowany były gwiazdor szkolnej drużyny futbolowej. Ciało zostaje znalezione w toalecie. Przyczyną śmierci było uderzenie w głowę butelką szampana. Główną podejrzaną staje się żona zmarłego, która po raz kolejny przyłapała męża na zdradzie. Horatio zostaje wezwany do morderstwa policjanta, który pracował pod przykryciem, podobnie jak jego brat, Raymond. Eric odkrywa, że ktoś ich uprzedził i dokonał oględzin miejsca zbrodni bardzo skrupulatnie.

Seryjny morderca o pseudonimie Siekiera znów dostał odroczenie wykonania wyroku śmierci. Jego obrońca podważył wyniki badań DNA, które przed laty doprowadziły do skazania przestępcy. Matka jednej z jego ofiar nie ma siły znów przechodzić przez proces. Horatio Caine obiecuje jej, że do tego nie dopuści. Caine bada przypadki różnych aktów przemocy, które miały miejsce na Florydzie od czasu aresztowania psychopaty. W domu na plaży znów doszło do tragedii. Ktoś zaatakował młode małżeństwo i tylko kobiecie udało się cudem przeżyć.

W jednym z nielegalnych klubów nocnych dochodzi do eksplozji. Na miejsce zostają wezwani kryminalistycy z CSI. Horatio znajduje miejsce detonacji. Ryan potwierdza, że była ona przypadkowa, spowodowana przez głośną muzykę, która uruchomiła włącznik rtęciowy. Konstruktor bomby nie zdążył go wyłączyć, gdyż został ugodzony nożem. Na narzędziu zbrodni Horatio znajduje odcisk palca brata, który przed kilku laty zginął na służbie. Calleigh przeżywa szok, gdy na miejscu zbrodni ktoś przystawia jej do głowy broń.

Na cmentarzu zostaje zastrzelony gangster będący na przepustce udzielonej mu na pogrzeb matki. Detektywi ustalają tożsamość mordercy, któremu udało się uciec. Jego poszukiwania wiodą do domu dobrze sytuowanego przedsiębiorcy, którego będąca w ciąży pomoc domowa została zgwałcona... Do zespołu kryminalistyków dołącza ekspertka w dziedzinie badań DNA, Natalia Boa Vista.

Płonący jacht otaczają rekiny. W obawie przed śmiercią w płomieniach do wody skacze młoda kobieta i niknie pod wodą. Brat idzie jej na ratunek... Śledczy starają się rozwikłać jaki był przebieg tragicznego wydarzenia. Podejrzewają, że niemal każdy z członków rodziny coś ukrywa. Poszukiwania zaginionego ciała brata prowadzą do znalezienia pod wodą innych zwłok.

Osiemnastoletnia Sara Jennings zaginęła podczas szkolnej wycieczki w Miami. Ekipa CSI prowadzi poszukiwania, próbując odtworzyć związane z nastolatką wydarzenia feralnej nocy...

Tobey, ujęty przez policję w zakrwawionym ubraniu, w pisemnym zeznaniu przyznaje się do popełnienia morderstwa. Jednak detektyw Horatio Caine nie wierzy w jego winę. W więzieniu Tobey zabija współwięźnia. Choć nie podaje powodów, dochodzenie CSI wykazuje, że zabił w obronie własnej.

Zostaje zamordowany pracownik hotelu. Podejrzane są trzy gospodynie domowe spod Miami, które miały spędzić tu weekend w swoim towarzystwie. Calleigh, Delko i Ryan zbierają dowody, które dodatkowo komplikują śledztwo, zamiast rzecz rozjaśniać. Horatio Caine pozwala pracować podwładnym bez własnej pomocy.

Samochód z dwiema nastolatkami wpada do wody. Podczas akcji ratunkowej zostają znalezione zwłoki kobiety nie związanej z wypadkiem. Ofiarą jest Rachel Turner, znajoma Horatio Caine’a. Wstępne śledztwo pozwala ustalić, że ofiara przed śmiercią spotkała się z kimś u siebie w domu. Ślady pozostawione na miejscu spotkania wskazują na Horatio Caine'a. Tym samym staje się on głównym podejrzanym.

Skazany seryjny morderca Henry Darius ucieka po dokonanym z jego inicjatywy sabotażu w samolocie transportującym go z Nowego Jorku do Miami. Na drodze ucieczki zabija stających mu na przeszkodzie niewinnych ludzi. Porywa też pewną studentkę... W więzieniu Darius nawiązał korespondencyjny kontakt z bogatą Joann Nivens, która obiecała mu pomoc.

Brenda Hall zostaje znaleziona martwa w domu swojego eksmęża, Gary’ego. Alexx ustala, że kobieta została postrzelona z uszkodzonej gwoździarki. Calleigh jest wściekła, kiedy Eric po raz kolejny nie odbiera wezwania. Detektywi ustalają, że były mąż ofiary i jego narzeczona mieli motyw, żeby zabić Brendę, gdyż przez ostatnie tygodnie ciągle ich nękała. Delko odbiera wezwanie z miejsca zbrodni od rannego policjanta. Okazuje się, że to Ryan, którego ktoś postrzelił z gwoździarki w okolice oka.

Trzech zamaskowanych napastników napada na bank. Kradną stosunkowo niewielką sumę pieniędzy i uprowadzają dyrektora. Jednego z nich wkrótce udaje się zatrzymać, a na jaw wychodzi fakt, że cały rabunek jest odwzorowaniem fabuły pewnej gry komputerowej.

Calleigh i Ryan uczestniczą w śledztwie dotyczącym zabójstwa handlarza narkotyków, Jaya Fishera. Wpadają na trop łowcy nagród. Ubocznym skutkiem tego śledztwa jest dochodzenie wszczęte przez wydział wewnętrzny w sprawie zażywania marihuany przez Erica Delko.

Brian Lexington skazany przed laty za gwałt zostaje oczyszczony z zarzutów, dzięki nowym technikom badań DNA, i wychodzi na wolność. CSI po latach szuka rzeczywistego gwałciciela. Calleigh i Wolfe ponownie badają zgromadzone w sprawie dowody. Alexx i Eric badają sprawę chirurga, którego pacjentka zmarła wskutek wstrząsu toksycznego po usunięciu wyrostka robaczkowego.

Wayne jest właścicielem klubu, w którym nieśmiali mężczyźni praktykują uwodzenie kobiet. Manning w jednym z pokoi znajduje ukryte w szafie zwłoki Sandersa. Tymczasem aresztowana zostaje w czasie zakupu narkotyków siostra Erica Delko. Na pomoc wzywa Horatia Caine'a.

Claire tańczy sambę; przyłącza się do niej Jose. Nagle ktoś do nich strzela. Horatio zauważa na piersi zabitego znajomy tatuaż organizacji nikaraguańskich gangsterów. Wydaje się, że mężczyzna był głównym celem zamachu, a kobieta zginęła przez przypadek...

Sienna i Leo dokonują napadu. Na otwierającym się moście zwodzonym dopada ich policja. Kobieta rozrzuca skradzione pieniądze. Otwarty most ukazuje ofiarę innego przestępstwa... Ryan ma cały czas kłopoty ze wzrokiem.

Cooper i Delko oglądają mecz siatkówki plażowej kobiet. Jedna z zawodniczek natyka się na ludzką rękę tuż pod powierzchnią boiska. Delko wzywa ekipę CSI do zakopanych zwłok. Alex ogląda miejsce zbrodni...

Agenci badają sprawę śmierci mężczyzny karanego w przeszłości za pedofilię. Jego ciało z raną kłutą znaleziono w parku w pobliżu jego miejsca zamieszkania. Alexx otrzymuje od przełożonego obietnicę awansu; warunkiem jest opuszczenie przez nią dziennej zmiany, którą kieruje Horatio Caine...

W wypadku samochodowym ginie kobieta. Tak przynajmniej wydaje się w pierwszej chwili; dochodzenie wykazuje, że sam wypadek przeżyła i już po nim została zamordowana. Poza tym w bagażniku jej samochodu schowane jest ciało mężczyzny... Ponadto detektywi znajdują w samochodzie drogocenny brylant, który wiedzie ich do pewnego sklepu jubilerskiego...

Agenci badają sprawę tajemniczego zniknięcia Melissy Rowe. Jej mąż zostaje oczyszczony z zarzutów, ale Caine jest przekonany o jego winie. Tuż po procesie, który miał charakter poszlakowy, ciało Melissy zostaje przypadkiem wyłowione. Jednak tzw. podwójne zagrożenie powoduje, że jej mąż nie może być sądzony drugi raz pod tym samym zarzutem. Śledczy jednak zaczynają podejrzewać go o inne morderstwo...