Filmy morderca, usa, postrzelenie, piękna kobieta, waszyngton

James Clayton rozpoczyna właśnie swoją pracę dla CIA. Jego inteligencja i błyskotliwość przyciągają uwagę Waltera Burke′a starego instruktora, który pomaga młodemu rekrutowi w serii trudnych szkoleń i wspinaczce po szczeblach kariery. Szansa na awans pojawia się, gdy Clayton otrzymuje zadanie zdemaskowania szpiega, który wniknął do CIA.

Wynalezienie lekarstwa odwracającego proces mutowania prowadzi do odwrócenia biegu historii. Po raz pierwszy mutanty stają przed wyborem: zachować swą unikalność, co oznacza skazanie się na wieczną izolację i alienację, czy też wyrzec się pozyskanej w wyniku mutacji mocy. Przeciwstawne punkty widzenia przywódców mutantów - Charlesa Xaviera, który naucza tolerancji, i Erika Lehnsherra, który wierzy w przetrwanie najsilniejszych, zostają poddane ostatecznej próbie - dochodzi do wojny, która ma rozstrzygnąć wszelkie spory.

Frank Horrigan (Clint Eastwood) jest zaprawionym w bojach agentem amerykańskich służb specjalnych, którego prześladuje poczucie winy i klęski, kiedy na jego oczach zamordowano prezydenta Kennedy'ego. Frank, który pełnił wtedy służbę, czuje że powinien był zareagować szybciej i zasłonić prezydenta własnym ciałem. Trzydzieści lat później tajemniczy szantażysta grozi śmiercią aktualnemu prezydentowi Stanów Zjednoczonych, który szykuje się do kolejnych wyborów. Horrigan ma pomóc w śledztwie, które zapowiada się na rutynowe dochodzenie. Kiedy odkrywa, że tropem prezydenta podąża zawodowy morderca i mistrz kamuflażu, Loary (John Malkovich), dochodzenie zmienia się w pasjonujący pojedynek. Loary zna prawdę o wydarzeniach z przeszłości i rzuca wyzwanie Horriganowi wciągając go w śmiertelną rozgrywkę, która postawi Franka wprost NA LINII OGNIA.

Wydarzenia przedstawione w filmie, maja miejsce niedługo po części pierwszej. Tym razem dochodzi do znacznego pogorszenia stosunków, między ludźmi i mutantami. Pewna organizacja rządowa, dokonuje ataku na szkołę Xaviera. Porywają oni większości uczniów, z zamiarem uczynienia z nich broni przeciwko mutantom. Z ataku udaje się jednak uciec kilku członkom X-MEN, którzy łączą swoje siły z Magneto i atakują siedzibę organizacji.