Organizacja przestępcza o nazwie Spiritual Ninjas przechwytuje walizkę wypełniona narkotykami. Policja wraz z wojskiem próbuje odzyskać walizkę, ale na drodze stróżów prawa stają świetnie wyszkoleni ninja.
Podczas transportu mikrofilmu zawierającego niezwykle cenne odkrycie naukowe, kurier zostaje zaatakowany a klisza skradziona. CIA chcąc ją odzyskać wysyła do Hongkongu swojego najlepszego agenta Tommyego. Na miejscu okazuje się, że by ją zdobyć mężczyzna, będzie musiał pokonać nasłanych na niego zabójców ninja.
Klan czarnych ninja odkrywa, że przedsiębiorca Bernard Wong znalazł miejsce spoczynku ich przodków. Gdy Wong nie chce sprzedać ziemi ninja wysyłają wiedźmę by zabiła całą jego rodzinę. W tym samym czasie na miejsce przybywa diamentowy ninja Gordon.
Grupa ekstremistów porywa podróżujących po Filipinach turystów, by wymienić ich za jednego ze swoich towarzyszy przebywającego w więzieniu. Chcąc uwolnić zakładników władze sprowadzają do kraju specjalny, trzyosobowy zespół, w którego skład wchodzi ninja Spike Shinobi, komandos Steve Gordon i piękna Jennifer Barnes.
Wojownik Ninja, Jubei, wspiera japoński rząd podczas akcji uwalniania pewnej wioski od sekty religijnej. Udaje mu się zabić i poskromić domniemanego Jezusa. Tym niemniej, ledwie ów wyzionie ducha, powraca do życia jako ucieleśnienie Szatana. Zapowiada się krwawa walka, której kres położyć może tylko rozsądny Jubei.
Lord Donjo zawiera układ z czarownikiem Kashinem Koji, by zdobyć serce pięknej Ukio, co wypełni przepowiednię dając mu władzę i pieniądze. Na drodze jego planów staje jednak ninja Jotaro, który zrobi wszystko by ocalić ukochaną. Niestety nie będzie to proste gdyż przyjdzie mu zmierzyć się z ze śmiercionośną drużyną „Diabelskich Mnichów” i piekielnym czarnoksiężnikiem.
Legenda głosi, że Tańczący Ninja ocali świat przed złem. Pojawi się jako sierota w małej wiosce i zaopiekuje się nim skromna, szlachetna rodzina. Jako młody chłopiec odkryje swoje wyjątkowe talenty poprzez taniec. Lecz każda dobra siła ma swoją przeciwwagę - i ich przeznaczeniem jest spotkanie. Dojdzie do niego, gdy Ikki wyruszy do Hollywood w poszukiwaniu swoich biologicznych rodziców.
W roku 2084 rasa ludzka zostaje niemal eksterminowana, przez przybyłych nie wiadomo skąd obcych. W jednej z ostatnich placówek, naukowcy konstruują urządzenie pozwalające na podróże w czasie. Dzięki niemu młoda dziewczyna Milly, zostaje cofnięta do roku 2002, by zapowiedz wojnie. Na miejscu łączy swoje siły z rewolwerowcem Miyamoto, przeciwko szefowi lokalnej mafii Mizoguchi, który jak się okazuje przetrzymuje pierwszego przybyłego na Ziemię obcego.
Detektyw Angel Wolfe, rozpoczyna własne śledztwo próbując odszukać zabójców brata. Trop wiedzie ją do Dr. Sin Do i jego małego imperium, na jednej z tropikalnych wysp. By się tam dostać Angel prosi o pomoc swoje dwie przyjaciółki i razem wyruszają na organizowany przez Sin Do turniej.
Troje mistrzów sztuki walk napada na handlarzy, by zabrać zgromadzone przez nich złoto. Z masakry cało wychodzi jedynie młody chłopak. Ciężko pobitego odnajduje miejscowy trumniarz i zaczyna szkolić w swoim fachu, przy okazji trenując sztuki walki. W tym samym czasie pewien ninja rozlicza się ze swoim dawnym rywalem i jego uczniami.