W roku 1992 do Japonii przybywają wysłannicy z przyszłości i przestrzegają, że należy zniszczyć Godzillę, gdyż wkrótce doprowadzi ona do tragedii i zniszczy Japonię. Okazuje się także, że Godzilla była kiedyś Tyranozaurem, ale pod wpływem promieniowania i reakcji jądrowych przeprowadzonych przez ludzi zmutowała. Plan zlikwidowania Godzilli udaje się, ale doprowadza do powstania innego monstrum - Kinga Ghidorah, który pustoszy Japonię i tylko Godzilla może go pokonać. Znów zostaje wysłana ekspedycja, by tym razem uratować Godzillę. Doprowadza to do pojedynku w miastach Japonii pomiędzy dwoma monstrami. Godzilla po wygranej zaczyna pustoszyć Japonię. I tylko zmodyfikowany King Ghidorah jest w stanie ją powstrzymać. A jak się okazuje, Ci z przyszłości nie są dokładnie tymi, za których się podają...
Kobieca załoga jednego z bombowców B-52, dostaje zadanie przetransportowania tajnego ładunku, wraz z trzema eskortującymi go żołnierzami. W trakcie lotu samolot wpada w burzę i zostaje zaatakowany przez nieznane zwierzę. Pomimo uszkodzeń pilotkom udaje się wylądować na malutkiej wyspie, gdzie resztki japońskiego garnizonu ukrywają się przed hordami latających dinozaurów.
Godzilla wraca by raz jeszcze sterroryzować Tokio! Tym razem ludzie uzbrojeni są w nową broń, która otwiera "czarne dziury" w przestrzeni. Do jednej z nich chcą zwabić legendarnego jaszczura. Zamiast tego sprowadzają na ziemię plagę gigantycznych ważek. Zaczyna się bitwa, w której naprzeciw słynnego gada stają ludzie i matka krwiożerczych owadów – Megaguirus.
Po wybuchu bomby atomowej kobietom zaczynają rosnąć brody i stają się bezpłodne. By rozwiązać problem wyginięcia ludności, zorganizowano spotkanie Narodów Zjednoczonych. Postanowiono, że zostanie stworzony wehikuł czasu, by przenieść się w przeszłość i zabić Einsteina. To on zrobił obliczenia matematyczne, które były przydatne do tworzenia bomb atomowych.
W wyniku kolejnej mutacji temperatura Godzili zaczyna rosnąć, grożąc eksplozją o sile mogącej zniszczyć świat. Gdy jednostka G-Force robi wszystko by zamrozić giganta, w Japonii pojawiają się kilkumetrowe potwory powstałe w wyniku użycia niszczyciela tlenu.
Obcy chcąc zapanować nad Ziemią, tworzą mechanicznego robota przypominającego Godzillę. Android pokonuje Godzillę w pierwszym starciu, ale sam zostaje uszkodzony. By wygrać kolejną bitwę, grupa ludzi chce przebudzić Króla Seesara, który pomógł by Godzili w pokonaniu robota.
Ziemi grozi zagłada. Gwałtowne wyładowania na powierzchni Słońca. uwalniają lecącą w stronę naszej planety zabójczą plazmę. Lucas Foster, genialny naukowiec jako jedyny ma plan ocalenia ludzkości. Jego realizacja jest jednak niemożliwa bez niekonwencjonalnego wykorzystania broni masowej zagłady. Gdy satelity spadają na ziemię, a niebo staje w płomieniach Foster podejmuje się trudnej misji.
Na jednej z budów pod Los Angeles robotnicy znajdują zwłoki dziewczyny. Allison była prostytutką, przyjmowała bogatych i wpływowych klientów. Policjanci z brygady specjalnej rozpoczynają śledztwo. Na światło dzienne wychodzą tajemnice, w które wmieszani są wpływowi obywatele.