Serial opowiada o grupie badawczej, która w poszukiwaniu technologii pradawnych przybyła do innej galaktyki i "osiedliła" się w opuszczonej przez nich bazie "Atlantis". Napotykają jednak groźnego przeciwnika - rasę obcych (Wraith), którzy żywią się ludźmi, wysysając z nich "lata życia".
Młody policyjny naukowiec Barry Allen pomaga w chwytaniu przestępców. Jego prawdziwą obsesją jest jednak akcelerator cząsteczek stworzony przez fizyka Harrisona Wellsa. Pewnego dnia dochodzi do eksplozji urządzenia, a Barry zostaje porażony piorunem i zapada w śpiączkę na dziewięć miesięcy. Po wybudzeniu się odkrywa, że posiadł nadludzką szybkość. Pozyskaną moc zaczyna wykorzystywać do walki ze złem w mieście Central City.
David Haller - zagubiony, młody mężczyzna obdarzony nadludzkimi zdolnościami - od lat zmaga się z chorobą psychiczną. Był jeszcze dzieckiem, gdy zdiagnozowano u niego schizofrenię. Od lat leczony jest w szpitalach psychiatrycznych. Z czasem David zaczyna uświadamiać sobie, że słyszane przez niego głosy oraz wizje mogą być prawdziwe.
Po ataku obcych na Ziemię, świat pogrąża się w całkowitym chaosie. Po sześciu miesiącach od pierwszej inwazji, garstka ocalałych jednoczy się i zbiera siły do walki z wrogiem. Każdy dzień jest dla nich próbą przetrwania. Muszą ochronić tych, którzy przetrwali, nie przerywając walki z kosmicznym okupantem.
Tajemniczy, dziwaczny osobnik przedstawiający się po prostu jako Doktor, podróżuje w czasie i przestrzeni za pomocą urządzenia o nazwie T.A.R.D.I.S., które z kolei zakamuflowane jest w niebieskiej budce policyjnej. Doktor jest jednym z Władców Czasu z planety Gallifrey, z których każdy po śmierci regeneruje się w nowym ciele (dzięki czemu Doktora grało do tej pory dziesięciu aktorów), choć każdy z Władców zrobić to może jedynie dwanaście razy. Poszczególne wcielenia Doktora różnią się nie tylko wyglądem, ale również osobowością.
Podróże incognito po świecie. Walka z przestępcami. Zmagania z własnymi demonami. Tak wygląda każdy dzień niecodziennej pracy tajnej agentki Sydney Bristow. Sytuację dodatkowo komplikuje fakt, że przełożonym Sydney w CIA jest jej ojciec, Jack, z którym dawno zerwała kontakty. Dzięki charakteryzacji i tajnej broni Sydney przenika do niebezpiecznego półświatka, odkrywa rodzinne sekrety i ukryte zamiary, a końcu znajduje również miłość. Nie sposób zliczyć przygód i intryg, przed którymi staje agentka w tym niezwykle wybuchowym współczesnym serialu, który magazyn TV Guide nazywa „niesamowicie wciągającym thrillerem”.
W świecie, w którym zmutowani ludzie są traktowani z nieufnością i strachem para zwyczajnych rodziców odkrywa, że ich dzieci posiadają nadprzyrodzone zdolności. Zmuszona do ucieczki przed rządem rodzina przyłącza się do podziemnej siatki mutantów i wraz z nimi rozpoczyna walkę o przetrwanie.